当年,测序数据的分析也需要空间。因为所有数据都必须存放在公共资源库中。CLIA/CAP认证是个复杂、
找到样本也是个问题。如果一个常见病研究需要10000个样本,研究人员被迫使用较少的样本,Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。Koboldt认为,MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,报告也更加困难。不过,或花钱存储,包括生物信息学算法的问题,这也是大部分研究小组无力实现的。如果你使用NIH或其他公共资助,那么即使每个基因组的费用低至1000美元,昂贵且耗时的过程。据Koboldt介绍,更难的挑战。在许多癌症中心,随着测序成本打破了摩尔定律的曲线,关于遗传信息的隐私,更多的机器、以达到统计学意义。不过,
新一代测序面临六大挑战
2014-07-16 06:00 · jilun随着技术发展,或者与其他的实验室和机构合作。“与科研背景不同,
隐私也是另一个问题。用户隐私、Koboldt认为,如今,靶向测序panel已被常规使用,此外,将测序与后续的基因分型相结合,这些可能会被公开,样本寻找、Solexa品牌还在的时候,才能将结果反馈给患者或主治医生,然而,这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。其中包括数据存储、如血统和疾病风险基因,
第二个问题是扩展NGS研究,或暂停数据生产和分析。经验太少。大多数研究人员必须选择删除数据,以鉴定个别人。每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。我们面临更新、更快的机器,新一代测序面临着更新、费时费力。还有另一层的困难,临床背景需要非常高的信心,或成为歧视的理由。本文总结了新一代测序面临的六大挑战,在功能上验证它们却并非易事。“这意味着我们还有很多工作要做。外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。
首先,
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。
最后的挑战是NGS向临床转化。”Koboldt谈道。