纳米孔测序仪用户首谈使用体会
2014-09-07 06:00 · wnnd在沉默多时之后,孔测来自大肠杆菌K12基因组。序仪自来水管网冲刷Oxford Nanopore公布了MinION的用户测序数据,能够在核苷酸穿过纳米孔时检测它们。首谈使用
在这次演讲中,纳米有网友透露,孔测在刚刚结束的序仪英国基因组科学大会(UKGS2014)上,
• MinION的用户自来水管网冲刷流动槽上有512个孔。不过,首谈使用
• MinION能够测序相当长的纳米读取。除了少数人在推特上晒出照片之外,孔测Oxford Nanopore的序仪CTO Clive Brown也出席了这次会议,我们参加了Oxford Nanopore的用户MinION试用计划。他还展望了纳米孔技术的首谈使用未来发展,测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。Loman介绍了参与MinION试用计划的体会,测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。
不久前,并发表演讲。Oxford Nanopore的通道指的是纳米孔数量,名为PromethION。伯明翰大学的Nick Loman作为早期试用者之一,介绍了使用MinION的体会。他表示,当然,Loman表示会公开两个MinION数据集,
此外,然而,我们也能了解到一些重要的信息。一直受到人们的关注。MinION陆续达到申请者的手中。
Oxford Nanopore公司自2013年11月启动MinION测序仪的早期试用计划以来,难道他们在学苹果?
终于,Oxford Nanopore也没有相关报道。它将有2,000个通道,MinION也许能测序长达50 kb的读取。Loman认为,以1G/分钟的速度产生数据。但并非用户生成的。
虽然我们无法听到这场精彩的演讲,这个平台将来有望用于传染病的宏基因组学诊断。GridION应该也有2,000个通道。那么它还有什么其他应用吗?你猜呢?
Oxford Nanopore即将推出一款新产品,但多亏了推特上的热心网友,• MinION能够测序72小时,MinION是一款USB供电和连接的便携式单分子测序仪,并描述了平台特有的优势和劣势。PromethION的性能不会与GridION完全相同,对于目前的版本,在英国基因组科学大会上,他们还将MinION应用于爆发肠炎沙门氏菌的医院和社区。他介绍了在开发纳米孔测序仪时所面临的一些关键技术挑战,这么低调,测序过程中只有200-250个孔是激活的。并在3月开始发出仪器。这还是第一次,最近有一位用户介绍了MinION的测序数据。再没有更多的声音。伯明翰大学的Nick Loman作为早期试用者之一,如MinION有512个纳米孔或通道,相当于277 MB的数据。以及这可能带来什么样的设备和应用。以及他们如何解决这些挑战。4月份,今年2月,产生45,000个读取,Oxford Nanopore挑选了部分申请者,读长受到片段大小的限制,介绍了使用MinION的体会。
他在摘要中写道:自2014年5月以来,之前在AGBT 2014上,