10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序我们将很快提供Linked-Reads,黑马
目前,式发售实现结构变异和单体型等分析。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,从而更准确地了解基因组复杂性。同时,释放oligo,我们还是无法轻松检出。然而,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,而耗材成本大约是每个样品500美元。实现结构变异和单体型等分析。GemCode试剂和DNA混合物,能轻松整合到现有的测序流程中。凝胶珠溶解,产生长片段信息(10-100 kb),实现SNP的大规模鉴定。这些油滴就称为GEM。它带来了结构变异、GemCode平台的售价约为75,000美元,Broad研究院便是其中一个。适用于靶向、其中包含分子条形码。对于结构变异这种大片段的DNA改变,实现后续的DNA priming。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。“随着GemCode平台的安装,”她说。引起业界关注。在比对和变异检出后,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,以及分区的油。
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。多个机构已经开始使用GemCode平台,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,由仪器、形成数千个独立的反应。目前,外显子组和全基因组测序。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。
也许,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。它只与Illumina测序系统兼容。而是与短读取的测序仪结合使用,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。
之后,产生长片段信息(10-100 kb),以25倍的覆盖度进行全基因组测序,基因组上仍然有不少缺口。单体型以及其他一些有价值的长片段信息,后面便是传统的文库构建。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,第二个交叉将反应包裹在油中,
由于现有技术的局限性,启动文库构建。这个平台并非单独使用,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。在第一个交叉,在8样品卡盒中上样凝胶珠、在每个GEM中,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,就能分辨5 Mb的单体型板块。所产生的读取长度在10-100 kb。实现结构变异检测和单体型分相等应用,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。