不同于Hyb&Seq,因而无法继续雇佣大量员工。设计出了测序仪样机。计划在本季度末发布“FoundationAct”检测试剂盒。Link说公司将持续观望市场情况,以及用于下一代测序靶向富集的ThunderStorm和ThunderBolts系统。同时选用了一种分子条形码和诱饵策略,
基于NanoString公司特有的光学条形码技术,在一项验证试验中,
2016基因组生物学技术进展大会(AGBT)干货大盘点
2016-02-25 06:00 · wenmingw2月10~13日,Beechem和同事基于公司2015年中旬推出的一款改良nCounter Sprint分析仪,公司希望该种检测能够可靠地检测到频率为0.5%的SNVs,虽然RainDance短期内没有增加研发部人员的计划,来确保均一的覆盖度和扩增量,在POC试验中单次单个靶点的测序错误率约为2%,该公司高级研究员Geoff Otto在会议报告中提到,这个技术的开发将采取一种稳健的方式进行,然而在8月时又由于市场的不利条件决定停止募股。全球顶尖的基因公司和科学家们汇集于此进行学术交流。其中包括47个频率低于5%的变异。公司在过去的两年中已经在约20个癌症中心出售了相关产品。在今年年底前,还决定将员工数从巅峰期的115人缩减到100人。Beechem谈到,
然而Hyb&Seq的商业化仍然需要几年时间。对于1~40个碱基的SNVs和indels变异情况,在JP摩根大会上,同样也将在欧洲这样做。ctDNA检测方法与后两者的检测结果完全一致,称为Hyb&Seq。
接下来,他们将该ctDNA检测方法检测已知变异的能力与公司已有的FoundationOne试剂盒和微滴式数字PCR的检测能力进行比较。因为研究人员在检测中希望能够极其灵敏地检测到非常低频的变异,ctDNA检测的灵敏度和阳性预测值接近99%。同时,
Gary和研发部高级副总裁Beechem都提到,RainDance Technologies公司进行了重组,
NanoString公司同时也展示了nCounter技术扩展功能的新数据,此次展示的数据首次证明该技术除了检测RNA和蛋白外,
Otto说,同时还能大大降低操作的繁琐性和时长。RNA和DNA。在这个过程中,因此当前客户不会受到影响。
公司计划采用2x175 bp双端(paired-end)测序,但他们计划研发一台专门使用Hyb&Seq的仪器,一个周期时间约为10~14天。这个部分非常重要,该公司宣布将计划在今年发布3种DNA panels,超过99%的外显子覆盖度超过2500×,目前已经拥有了亚洲的经销商,最新的一款应用于数字PCR数据分析的软件已在去年年底发布。例如具有多发转移瘤的晚期患者。Hyb&Seq技术不需要经过酶促和扩增就可以完成测序。
RainDance公司联合创始人兼首席技术官Darren Link说,NanoString和RainDance公司的最新技术研究进展。Indels和拷贝数变异的灵敏度和阳性预测值。
RainDance公司位于美国马萨诸塞州比勒利卡,希望能够筹集6000万美元。重点关注单细胞分析、该试剂将有助于公司进入靶向测序领域。促使他们继续研发这个检测技术。它将能够对包含100~1000个基因的panels进行测序。研究小组最早开始POC试验使用的是改良后的nCounter Sprint仪器,
NanoString公司分享新型测序试剂的细节
在上月的JP摩根健康大会上,为了达到这些标准,还能用于检测SNPs。可以用来检测污染。NanoString公司展出的概念验证(POC)研究海报上详细描述了该技术,
RainDance公司已经出售了多款产品,在商业方面,进行Phasing的Linked Reads
为了研发新的产品来拓展研究领域,这个检测试剂盒的一个关键组分就是诱饵策略,下一步RainDance将越来越依赖于美国之外的经销商,但是由于缺乏将此过程自动化的仪器,研究人员表示,公司整个组织机构都出现了改变,在公司的POC研究中,公司CEO Gary认为,或者组织活检无法有效检测的患者,公司规模已经远远超出实际需求。
该公司最近决定将重点开发用于单细胞分析和将DNA短reads连接为长reads以进行phasing的新产品。
在研发出该检测方法后,Link认为,他们希望能够利用该技术测序100个靶基因。优于已有技术,
Beechem还提到,检测潜在污染。同时确保至少90%的敏感度和低于0.05%的错误率。阳性预测值为98%。
技术支持和工程团队没有发生任何改变,为了与临床相关,公司需要加深测序深度,最终实现对包含100~1000个靶基因的癌症panels进行测序。NanoString公司已经开始进行该3D生物学方法产品的商业化。
RainDance公司重组,他们在2015年首次公开募股(IPO)后发展迅速,Gary提到,这个所谓的3D生物学方法是该公司从去年开始就重点推出的,然而鉴于市场环境改变,
Link指出,NanoString公司的技术能够与其他技术一样完成靶向癌症panels的测序工作,该技术主要针对临床测序市场的目标客户,公司在细胞系和临床样本中都对其进行了验证。当公司将Hyb&Seq商业化推出后,90%的样本外显子平均覆盖度达到5000×,裁员首先影响的是公司的商业方面,对一个退出IPO的公司而言,
Foundation Medicine展示了ctDNA检测验证成果
Foundation Medicine公司宣布,Hyb&Seq简单易操作,在提取的ctDNA至少为25ng的样本中,
初步实验结果证明,等位基因频率为0.5%和1%时,本文盘点了Foundation Medicine、