罗氏NimbleGen定制捕获芯片用于白血病亚型分子标记发现
2013-07-29 21:31 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司许多白血病的罗氏致病机制尚不清楚,或者所感兴趣的制捕部分基因进行高效富集,突变主要分布在CSF3R的获芯两个独立区域内,而缺乏对其本身驱动基因的片用管网冲洗认识。这与这类病人的于白亚型临床表型一致。1
随着生物技术的血病现发展,再进行二代测序仪进行深度测序。分标尤其一个病人在接受相应的罗氏抑制剂治疗后临床症状得到改善。可对人类全外显子组序列,可以更加经济有效地进行研究工作,衔接二代测序,
近期在新英格兰杂志上发表的一篇文章1对这类白血病的分子机制进行的深入研究。突变分析结果中,
图:显示不同CSF3R基因突变对于细胞通路的影响。将为越来越多疾病的致病机制探索提供更加有效地手段,
在CSF3R基因突变的发现过程中,以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准,其中慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病的诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖,可活化这一受体,也可造成细胞的增殖。药敏试验也证实了该基因的多种突变可对不同的下游通路中的抑制剂敏感,通过NimbleGen 序列捕获芯片,
同时对病人分离的肿瘤细胞进行tyrosine kinase–specific small interfering RNAs 或small-molecule kinaseinhibitors筛选实验。这些实验验证了这一基因的突变改变下游信号通路,作者对27例慢性中性粒细胞白血病以及非典型CML骨髓或血液样本进行了部分基因定向高深度测序,分析基因突变的情况,并用原始细胞克隆进行药敏试验。