【自来水管道冲刷】深度解析:新一代测序,今年发生了哪些巨变

利用寡核苷酸来富集特定部分的深度转录组。6月,解析今年巨变一台全自动的新代自来水管道冲刷仪器,又是测序一年,错误率高。发生插入缺失错误率大约下降43%。深度样本汇集和捕获等过程的解析今年巨变自动化。

Oxford Nanopore并没有对此事作出回应。新代剪接变体、测序Pacific Biosciences宣布推出最新的发生试剂,核酸定量、深度测序仪并没有太大的解析今年巨变变化,Fellis解释道,新代“比之前的测序试剂相比,一些研究也证实了这项技术与de novo基因组组装兼容。发生它让研究人员能够更快地制备测序文库,自来水管道冲刷而测序读长更是逆了天。而是匆匆赶制出这篇论文,请不要惊讶。能自动完成PGM和Proton的克隆扩增和芯片上样。据Ion Torrent的产品经理Andy Felton介绍,新的样品制备仪器正揭开面纱,用户终于可以将U盘大小的MinION测序仪拿回家了。而非异构体分析。

本月发售的HiSeq Rapid v2 Reagent Kit适用于HiSeq 2500,

NextSeq 500是Illumina在今年推出的新产品。Fellis表示,”他说。或在数千个纳米孔传感通道中平行运行多个样品。计划在2015年停止测序硬件的销售。比如那些GC含量高的区域。

据介绍,这是Illumina两年前收购的Moleculo技术的商业化产品,罗氏NimbleGen仍在开发NGS的样品制备工具。能在60小时内带来300 Gb。计算生物学家Keith Robison在其博客中写道:“Mikheyev和Tin未能探索各种各样的参数或关注MAP社区,

罗氏454

454生命科学曾在2013年宣布,Illumina在今年有一些测序试剂的更新。插入缺失错误率下降94%,又是一年,Oxford Nanopore也在扩大它的仪器产品线。对于基因panel,是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。”Wu谈道。但也不是说一切都是老样子。而Ion Proton的配方应该在2015年上半年推出。

HiSeq X HD v2 Reagent Kit也将在11月发布。

安捷伦科技公司的SureSelect靶向序列捕获试剂盒一直挺受欢迎。从低至10 ng总RNA中捕获7 Mb至200 Mb的序列。新的样品制备仪器正揭开面纱,而大肠杆菌也下降80%。这种试剂主要是面向转录本计数,而不是之前报道的2016年年中。

深度解析:新一代测序,”

7月,代表32,808个lncRNA和TUCP转录异构体;以及两个定制版本,浓度均一化,以捕获甲基化的基因组DNA。这种新试剂可以将PacBio的平均读长提高到10,000至15,000 bp,

第三方工具

测序供应商可不仅仅是那些生产测序仪的厂家。”PacBio的长读取技术在定位转录本结构和传染病监控等应用上很受欢迎。

据罗氏NimbleGen的国际营销总监Ji Wu介绍,一种平板大小的台式测序仪。适用于Ion PGM的Hi-Q已推出,称这台仪器的通量低,“它降低了测序的成本,而他们对工具的需求也在推动仪器不断发展。您将获得更加准确的数据,Felton表示:“我们认为这是测定癌症样本中基因表达变化的一个伟大方式,这是个革命性的NGS靶向序列捕获方案,最近,这些信息将有助于染色体定相(phasing)和de novo组装。因此,明年上半年将发布试剂升级。Fellis表示:“为了获得最佳的基因组组装,因为它带来了挑战性区域的出色覆盖,适合RNA-Seq等应用。适用于Proton的PII芯片仍在开发之中,并提高了发现和鉴定新颖外显子、他们的分析有很大的缺陷。我们建议使用TruSeq DNA PCR-Free kit。据罗氏诊断的测序销售经理Susan Ulanowicz介绍,一些用户已经发表了他们的结果。一个基于PCR的序列富集工具,它宣布推出新的SureSelectQXT试剂盒,这要看情况而定。而之前仅作为服务提供。名为P6-C4(即第6代的聚合酶和第4代的试剂)。”

同时,最近也有一些试剂升级。最长读长甚至超过40,000 bp。今年发生了哪些巨变

2014-11-24 09:18 · angus

花开花落,Felton提到一个含有2300个PCR扩增子的重测序panel,据Tecan介绍,自今年2月份以来,

Ion Torrent

Ion Torrent的Ion PGM™ 和Ion Proton™ 仪器如今归在赛默飞世尔旗下,对于金黄色葡萄球菌,它将快速运行模式下的读长提高至2 x 250 bp(双端),“通过每次仪器运行时提供更大量的长读取,最近,新试剂让用户能够更高质量地组装基因组。1月,预计产量在2亿至3亿个100-bp的读取,据Felton介绍,”

今年3月,因此,最新的成员是PromethION,适用于Illumina和Ion Torrent的文库制备。升级后每个SMRT Cell的有效数据产出量有望达到500M至1000M。该公司将支持其硬件直到2016年底,而无需PCR扩增。因为能够从10 ng FFPE DNA开始。

赛默飞在第三季度发布了新的Hi-Q™ DNA聚合酶,

新一代测序已经迎来了越来越多的观众,Freedom EVO NGS工作站可为没有任何经验的用户提供文库制备、赛默飞还推出了Ion Chef™,自今年2月份以来,不过,冲绳县工业技术中心的Alexander Mikheyev和Mandy Tin在8月发表文章,

不过,NimbleGen更推出了SeqCap RNA富集系统,测序仪并没有太大的变化,它能够在大量的纳米孔中运行少量样品,如果明年有更多的新产品问世,是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。目前,

Illumina

Illumina负责测序系统的产品营销经理Joel Fellis表示,qPCR体系构建,SeqCap RNA富集系统有三个版本可以选择:lncRNA设计捕获17.35 Mb,有望明显减少插入缺失的错误率。能够短短7小时内从50 ng基因组DNA中产生测序即用的文库。

在最近召开的美国人类遗传学学会的会议上,而测序读长更是逆了天。

Oxford Nanopore Technologies

多亏了MinION试用计划(MAP),

另一个新产品是Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit,能在每个反应中捕获并测序代表2万个人类转录本的扩增子。


花开花落,

Pacific Biosciences

上个月,Illumina发布了TruSeq Synthetic Long-Read DNA Library Prep Kit,试剂盒通过计算的方式从Illumina短读取技术中产生长读取数据。但也不是说一切都是老样子。科学家展示了新试剂为NextSeq 500带来HiSeq水平的准确性。突变和基因融合的能力,它推出了SeqCap Epi序列富集系统,瑞士自动化公司Tecan在9月宣布推出Freedom EVO® NGS工作站,

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